三门县有1个乡、6个镇。三门县，隶属于浙江省台州市，位于浙江省台州市东北部沿海。县域面积平方公里，其中海域面积近平方公里。地形为低山丘陵，地势西北高、东南低，由西北向东南倾斜，湫水山在中部蟠结耸峙；海岸线曲折，岛屿众多，港湾深嵌内陆。
三门县具有明显的亚热季风气候特征，冬夏长，春秋短，四季分明，雨水充沛，光照适宜，属浙中浙南冬次冷夏秋湿润、半湿润副区。县域辖1个乡、6个镇、3个街道。其中，三门县下辖的1个乡、6个镇，分别为：
1、蛇蟠乡
蛇蟠乡，隶属于浙江省台州市三门县，地处三门县北部偏东北，东滨东海，南与健跳镇隔蛇蟠水道相望，西北与宁海县一市镇相邻，东北濒青山港，行政区域面积23.21平方千米。蛇蟠乡辖4个行政村，乡人民政府驻黄泥洞村渔光曲路号。
蛇蟠乡，清代时期，属宁海县南乡葛岙庄。年5月，撤蒲西乡，蒲西乡山前、山后、黄泥洞3村与新设的邵亭、中南、彭坝3个村，成立蛇蟠乡。
2、花桥镇
花桥镇，隶属于浙江省台州市三门县，地处三门县南部，东与浦坝港镇相连，东南、南与小雄镇毗邻，西南、西与临海市桃渚镇、小芝镇为界，北与横渡镇接壤，行政区域面积83.05平方千米。花桥镇辖17个行政村，镇人民政府驻花桥村广场路88号。
花桥镇，清代时期，属临海县承恩乡城门、关头、吴都3个庄；年9月，花桥乡改称花桥镇；年5月，吴都、关头乡并入花桥镇；年，蜍下村划出。
3、浦坝港镇
浦坝港镇，隶属于浙江省台州市三门县，成立于年11月25日，由原浬浦、小雄、泗淋、沿赤等4个乡镇撤并而成。位于浙江省三门县东南，处浙东沿海，东海之滨，三门湾畔，三门县南大门。南界临海市桃渚镇，西毗花桥镇、横渡镇，北连健跳镇。辖区面积.2平方千米，是台州市面积最大的乡镇。浦坝港镇辖93个行政村，1个新城居委会。
4、健跳镇
健跳镇，浙江三门县下辖镇，位于浙江东部黄金海岸线中段。东滨猫头水道，南与浦坝港镇连接，西与横渡镇交界，北濒蛇蟠水道，面积.02平方千米。健跳镇辖3个居民区、72个行政村（不含原六敖镇的正屿村、涛头村），镇政府驻健农村南大街43号
健跳镇，明洪武二十年（年）设千户所。民国时称琴江乡。年解放后，改为健跳乡，年8月，为县属建制镇。年5月，改为区属建制镇。健跳属滨海平原地区，地势西高东低，健跳港横贯南部。
5、亭旁镇
亭旁镇，隶属于浙江省台州市三门县，地处三门县西南部，东与横渡镇相邻，南、西南与临海市东滕镇交界，西与高枧乡、珠岙镇相连，北与海游街道接壤，行政区域面积.19平方千米。亭旁镇辖54个行政村，镇人民政府驻杨家村宁和路号。
亭旁镇，清康熙四年（年），为台州海防分府驻地，设杨家庄、包家庄和任家庄，隶属宁海县。年10月，置亭旁镇。年，撤邵家、南溪、彭赖3个乡，设立亭旁镇、中门乡、坝头乡。年11月，中门、坝头乡2个乡并入亭旁镇。
6、珠岙镇
珠岙镇，隶属于浙江省台州市三门县，位于三门县西部，北接宁波市宁海县，西北界天台县，西南邻临海市，全镇总面积83.41平方千米。珠岙镇辖38个行政村，镇政府驻珠岙村。
7、横渡镇
横渡镇，隶属于浙江省台州市三门县，地处三门县中部偏南，东连健跳镇，南连花桥镇，西南与临海市东滕镇接壤，西接亭旁镇，北与海游街道毗邻，行政区域面积.63平方千米。横渡镇辖13个行政村，镇人民政府驻大横渡村横渡街28号。
横渡镇，清代时期，属宁海县南乡大横渡、小横渡、岭根陈3个庄；年10月，横渡乡改为横渡镇；年5月，桥头乡划入横渡镇。
此外，三门县下辖的3个街道，分别为：海润街道、海游街道、沙柳街道。
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